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Research Projects
Bioinformatics
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Copyright © ARC Centre of Excellence in Structural & Functional Microbial Genomics |
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Research Projects |
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| Research Projects | Industry & Government | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Bioinformatics |
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Antimicrobial targets | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Bioinformatics is the application of computer science, applied mathematics and statistics to solve molecular biological problems. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The ARC Centre of Excellence in Structural and Functional Microbial Genomics uses bioinformatic analysis of relevant genome sequences to identify: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| • | Potential virulence genes; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| • | Unique genes that may be essential for growth and survival and; | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| • | Genes encoding surface exposed or secreted antigens of the bacterial pathogens of interest. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The Centre uses WASABI to compare and mine novel genomic data. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The Centre is developing a target tracking Laboratory Information Management System (LIMS) to drive automated aspects of the High-throughput Microbial Pipeline. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| The Centre plans to improve software for proteomics and microarray analysis and develop databases for the integration and analysis of these complex data sets. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| For further information about the Centre’s methods of bioinformatic/genomic analysis please contact Centre Chief Investigators Professor Ross Coppel or Professor James Whisstock. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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